Sejak didirikan pada tahun 2002 BPDPL telah memiliki banyak mitra baik sebagai mitra kegiatan ataupun sebagai donor kegiatan lembaga-lembaga tersebut antara lain:

1. Pemerintah Propinsi Lampung
2. Pemerintah Kabupaten Lampung Selatan
3. BKSDA Lampung
   
4. Departemen Kelautan dan Perikanan
5. Fisheries Diving Club IPB
6. Dosen dan Mahasiswa IPB yang melakukan penelitian di Pulau Sebesi
7. Nancy Dahl T., Peneliti NOAA
8. Pusat Pembelajaran Pengelolaan Pesisir dan Lautan, Bogor
9. Yayasan Mitra Bentala, Bandar Lampung
10. Yayasan Telapak, Bogor
11. Greengrant Global Funds
12. INRR, Bogor
13. Balai Konservasi Sumberdaya Alam, Lampung
14. Rajawali Citra Televisi Indonesia, Jakarta
15. Rufford Small Grant
16. Samdhana Institut